J's Blog

我心有海,暗流澎湃

我在 2017 年或者更早,就搭建了自己的独立博客,那时主要写一些随笔,更的很少很慢。研究生和工作之后,开始转向写一些技术内容,当然了,主要是一些学习笔记,毕竟我还没有到能独立输出知识的地步。同时博客的更新频率也相对多了些。一方面,我关注的方向比较多,涉猎广泛杂乱;另一方面,我逐渐养成整理知识体系的习惯,并使用了一些 Markdown 类的管理工具,方便转成博客。

属于独立博客的时代已经过去了。我所坚持的似乎是一件很老套的事情,就如同在精心维护一片野花园,却处在偏远山中,少有人游览。但我觉得呢,那些花儿本身,就值得被栽种盛开。

我想,写博客的目的,首先是记录。“那些很渺小的东西,都是我人生的大事。”我始终保持对文字的敬畏,我们应该记录和表达一些东西。只可惜,我好像能静下来思考的时间越来越少,我好久没能写一篇完整的随笔。

其次,写博客的目的是共享。我很乐意分享我学习和总结到的一些东西,并期待在提供帮助的同时,也能收到一些反馈。从后台统计看,我很高兴一些内容似乎帮助到了某些陌生人,至少,对 AI 起了帮助。

此外,我认为比无知更可怕的是误解。我担心在传递这些内容的同时,由于我的不足也传递了谬误。所以,亲爱的陌生人,如果您有任何的疑问,请一定不要吝惜与我交流( jiangshen@outlook.com )。

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假设检验方法选择思维导图

2025.05.11

基于目前个人对统计学的理解,做了一个假设检验方法选择的思维导图。目前仅是从采集的数据类型切入的,对于假设检验方法的选择应该还是比较直观易懂。

如果是从自变量和因变量角度来看,如单因素方差分析,可以看作分类数据自变量对定量数据因变量的影响,因此也就能将“回归相关”纳入到一个更大体系里。后面可能也出一版这样的思维导图。

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基础知识

统计学的研究内容

统计学是关于数据资料的收集、整理、分析和推断的一门科学。它可分为描述统计学和推断统计学两大类。

描述统计学是研究数据收集、处理、描述及可视化的统计学方法,其内容包括如何取得研究所需要的数据,如何用图表形式对数据进行处理和展示,如何通过对数据的综合、概括与分析,得出所关心的数据特征。如果在研究中可以得到整个总体的数据,那么描述统计学就足够了。

但是,实际中往往只能得到总体的一小部分(称为样本),这就需要通过这些样本的有限的样本信息来推断有关总体特征,这就是推断统计学的研究领域,又分为参数估计和假设检验。

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血球计数板

血球计数板用优质厚玻璃制成,通过 H 形凹槽分为两个相同的计数池。每个计数池的两侧都有一个支持柱,上面覆盖着特制的盖玻片,形成高度为 0.10 mm 的计数池。

计数池内划分为长和宽各为 3 mm 的方格,总共分为 9 个大方格。每个大格面积为 1.0 mm,体积为 0.1 mm3,即一个大方格的体积是 0.1 μL。

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转膜

材料

  • 转印缓冲液(含有 20% 甲醇的 1X Tris-甘氨酸缓冲液)
试剂 用量 终浓度
10X Tris-甘氨酸缓冲液 100 mL 1X
甲醇 200 mL 20% (V/V)
去离子水 to 1000 mL

甲醇能减少凝胶的膨胀并提高蛋白质与硝酸纤维素膜的结合效率。转膜效率受以下因素影响:电泳缓冲液中是否存在 SDS、转膜缓冲液的 pH 及转膜前凝胶中的蛋白质是否已染色。为最大限度地提高转膜效率,SDS 的浓度不应超过 0.1%,转膜缓冲液 pH 必须 ≥8.0。

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SDS-PAGE 凝胶制备

材料

  • 30% 丙烯酰胺/N,N'-亚甲基双丙烯酰胺混合液(29∶1, m/m)
  • 10% 过硫酸铵(APS, m/V)
  • 10% SDS 溶液
  • 四甲基乙二胺(TEMED)
  • 1.5 M Tris-HCl(pH8.8)
  • 1.0 M Tris-HCl(pH6.8)
  • 去离子水
  • 异丙醇(或 70% 乙醇或水饱和丁醇)

设备

  • 垂直电泳槽
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细胞裂解和蛋白提取

材料

  • 哺乳动物悬浮或单层生长的细胞样品或组织样品
  • 裂解缓冲试剂
  • 蛋白酶抑制剂 Cocktail
  • 磷酸酶抑制剂 Cocktail

设备

  • 高效匀浆器(匀浆组织时选用)
  • 高速冷冻离心机
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总 RNA 提取

材料

  • 悬浮或单层生长的细胞样品或组织样品
  • 氯仿或1-溴-3-氯丙烷(氯仿,品牌:Greagent,型号/货号:G75915B)

溴氯丙烷是一种可取的氯仿替代物,因为它毒性更小且不易挥发。此外,溴氯丙烷可以提供更好的液相分离,从而更好地从总 RNA 中去除基因组 DNA,获得更纯的 RNA。

  • 异丙醇(异丙醇,品牌:Greagent,型号/货号:G75885B)
  • 糖原(20 mg/mL 储存液)(可选)
  • 无 RNase 的水(DEPC 水,品牌:Beyotime,型号/货号:R0022)
  • 乙醇(无水乙醇,品牌:Greagent,型号/货号:G73537AC)
  • 75% 乙醇(用无水乙醇和 DEPC 水配制)
  • 单相裂解试剂(如 TRIzol)(TriQuick Reagent 总 RNA 提取试剂,品牌:Solarbio,型号/货号:R1100)
  • 磷酸盐缓冲液(PBS)(1X)(PBS 缓冲液,品牌:Solarbio,型号/货号:P1020)
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  1. 每周更新一篇推文,保持写作和记录习惯;
  2. 合理安排时间,早睡早起,每周至少 4 天在 24:00 前睡觉;
  3. 必须参加 IELTS,并 ≥ 7.0;
  4. 对专业知识有系统的了解,对相关法规有较全面的认识;
  5. 锻炼,控制 BMI ≤ 22.0;
  6. 系统学习摄影知识;
  7. “宁可痛苦,不要麻木”,常留点时间思考,静下心来看几本书和几部电影;
  8. 多向外索取,表达是方式,而不是目的;
  9. 及时行动,勇敢不要犹豫。

实验动物相关生理参数

Table 1. Relevant physiological parameters for different animals1

Animal species Weight (kg) Blood volume (mL) Blood flow (mL/min) Total surface area (m^2) Life-span (year) Normal oral (mL/kg) Normal i.v. (mL/kg)
Mouse 0.02 1.7 Liver: 1.8; kidney: 1.3 0.008 2.7 10 5
Rat 0.25 13.5 Liver: 13.8; kidney: 9.2 0.023 4.7 5–10 2.5
Rabbit 2.5 165 Liver: 177; kidney: 80 0.17 8.0 5–10 1–2
Rhesus monkey 5 367 Liver: 218; kidney: 138 0.32 22 5–8 0.5–1
Dog 10 900 Liver: 309; kidney: 216 0.51 20 5–8 0.5–1

不同途径推荐给药体积

Table 2. Recommended Dose Volumes for Common Laboratory Animals2

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